Quelltext der Seite 2.3.3.3 Southern Hybridisierung (blotting, transfer)

Eine weitere Möglichkeit stellt die '''Southern Hybridisierung''' dar. Sie basiert auf folgender Vorgehensweise:
#Aus dem Agarosegel werden nach der DNA-Auftrennung die einzelnen Banden ausgeschnitten und die Gelstreifen in '''NaOH-Lösung''' gelegt (Denaturierung in Einzelstränge im Gel).
#Dann wird eine Glasplatte mit saugfähigem Filterpapier belegt, das mit einem Transferpuffer in Verbindung steht.
#Darauf werden die Gelstreifen mit geeignetem Abstand zueinander gelegt.
#Nun werden noch Nitrocellulose- oder Nylonmembranen aufgelegt, darüber angefeuchtetes Fließpapier und darüber mehrere Lagen trockenes Fließpapier und zuletzt alles mit Gewicht beschwert.
#Durch diesen Aufbau wird der Puffer vom und im Fließpapier hochgesaugt und nimmt dabei die DNA-Fragmente der Gelstreifen mit, wo sie im selben Muster wie vorher an der Membran hängenbleiben.
#Nun kann wie bei der '''Koloniehybridisierung''' fortgefahren werden.
Der gesamte Vorgang bis zur Hybridisierung wird oft als '''blotting''' bezeichnet.