2.3.2.2.2 Auswertung

Nach dem Abfotografieren des Gels werden auf dem Gelfoto die Banden eines mitgelaufenen Standards vermessen und die Wanderstrecke im Gel auf der Abszisse (x-Achse) gegen die Fragmentgrößen der sich in der jeweiligen Bande befindlichen DNA auf der Ordinate (y-Achse) auf halblogarithmischem Papier aufgetragen.

Beispiel:

Folgende Werte wurden erhoben:

Größe der Fragmente	y (lg(Größe der Fragmente))	x (Wanderstrecke in mm)
23.130 bp	4,36 bp	16,5
9.416 bp	3,97 bp	19,5
6.557 bp	3,82 bp	23,0
4.361 bp	3,64 bp	28,0
2.322 bp	3,37 bp	35,5
2.027 bp	3,31 bp	37,5

Tab. 16: Beispielwerte für eine Agarosegelelektrophorese

Daraus resultiert folgende Eichkurve:

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Abb. 56: Eichkurve für die Agarosegelelektrophorese (Beispiel)

Für die Daten aus Tab. 16 ergibt sich die dargestellte Eichkurve. Trägt man den logarithmierten Wert der Basengrößen des Standards gegen ihre Wanderstrecke auf, so erkennt man in einem Teil des Graphen einen linearen Zusammenhang. Manche der Punkte können bereits außerhalb des linearen Bereichs liegen (hier der rote Punkt). Die aufzutrennenden Fragmente sollten dann kleiner sein als das nicht zum linearen Teil gehörende Fragment. Anhand der Wanderstrecke der aufzutrennenden Fragmente kann durch eine solche Eichkurve auf die Fragmentlänge rückgeschlossen werden.