2.2.5.2.1 Aufbau der Ribosomenbindestelle
Die Basenabfolge der 16 S-rRNA ist bei allen Bakterien, insbes. an ihrem 3'-Ende, nahezu gleich. Zunächst bindet die kleine Ribosomen-Untereinheit an die Bindestelle vor dem Startcodon. Dies ist bei Prokaryonten die sog. SHINE-DALGARNO-Region (SHINE & DALGARNO 1974). Sie beginnt ca. 20 Basen vor dem Startcodon, von denen 7 – 9 für die Bindung wichtig sind. Diese 7 – 9 Basen haben bei allen Bakterien ganz ähnliche Abfolge und zeigen meistens nur 1 – 2 Abweichungen, z. B.
Daraus ergibt sich als passender Teil an die 16 S-rRNA folgende Consensussequenz[1]:
Ca. 7 – 9 Basen am 3'-Ende dieser 16 S-rRNA passen komplementär zu den entsprechenden Basen innerhalb der SHINE-DALGARNO-Region. Die vollständig komplementäre Basenabfolge auf der mRNA (Consensussequenz) kann aber nicht vorliegen, weil sonst später das Ribosom zu fest sitzen würde und nicht mehr weiterrutschen könnte.
[1]: optimale Basenabfolge für die Bindung an die 16 S-rRNA
